Хотя терапия корневых каналов имеет высокий уровень успеха, она не является безошибочной. Лечение может оказаться неудачным из-за сложной анатомии корневых каналов, которые не были полностью вылечены, необнаруженной трещины в корне зуба или реставрации, которая была отложена или неадекватна, что привело к загрязнению внутренних материалов. Если терапия корневых каналов не удалась, можно рассмотреть такие варианты, как повторное лечение, апикоэктомия (небольшая хирургическая операция) или, в некоторых случаях, удаление зуба.